MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 49585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020834	AAG	2	6	227515	227520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335477
4502	NC_020834	AAT	2	6	227545	227550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335477
4503	NC_020834	T	7	7	227582	227588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_020834	ACTG	2	8	227674	227681	25 %	25 %	25 %	25 %	472335478
4505	NC_020834	TTG	2	6	227705	227710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335478
4506	NC_020834	TTA	2	6	227738	227743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335478
4507	NC_020834	AG	3	6	227915	227920	50 %	0 %	50 %	0 %	472335478
4508	NC_020834	CAG	2	6	228041	228046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335478
4509	NC_020834	ATT	2	6	228089	228094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335478
4510	NC_020834	AAG	2	6	228126	228131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335478
4511	NC_020834	CGTG	2	8	228151	228158	0 %	25 %	50 %	25 %	472335478
4512	NC_020834	ATT	2	6	228299	228304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335478
4513	NC_020834	ATG	2	6	228308	228313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335478
4514	NC_020834	CCA	2	6	228344	228349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335478
4515	NC_020834	TGA	2	6	228556	228561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335478
4516	NC_020834	TGC	2	6	228586	228591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335478
4517	NC_020834	A	6	6	228647	228652	100 %	0 %	0 %	0 %	472335478
4518	NC_020834	ATT	2	6	228712	228717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335478
4519	NC_020834	TTGT	2	8	228728	228735	0 %	75 %	25 %	0 %	472335478
4520	NC_020834	AGA	2	6	228748	228753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335478
4521	NC_020834	GGT	2	6	228830	228835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335478
4522	NC_020834	TTG	2	6	228891	228896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335478
4523	NC_020834	TCC	2	6	228992	228997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335478
4524	NC_020834	GAT	2	6	229076	229081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335478
4525	NC_020834	GAA	2	6	229088	229093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335478
4526	NC_020834	ATG	2	6	229106	229111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335478
4527	NC_020834	GCA	2	6	229136	229141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335478
4528	NC_020834	AG	3	6	229144	229149	50 %	0 %	50 %	0 %	472335478
4529	NC_020834	A	6	6	229173	229178	100 %	0 %	0 %	0 %	472335479
4530	NC_020834	CTT	2	6	229221	229226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335479
4531	NC_020834	ATT	2	6	229264	229269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335479
4532	NC_020834	TTC	2	6	229270	229275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335479
4533	NC_020834	CGCAA	2	10	229301	229310	40 %	0 %	20 %	40 %	472335479
4534	NC_020834	GATC	2	8	229389	229396	25 %	25 %	25 %	25 %	472335479
4535	NC_020834	TC	3	6	229395	229400	0 %	50 %	0 %	50 %	472335479
4536	NC_020834	TAT	2	6	229443	229448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335479
4537	NC_020834	ATA	2	6	229457	229462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335479
4538	NC_020834	GCTG	2	8	229499	229506	0 %	25 %	50 %	25 %	472335479
4539	NC_020834	GTTTAG	2	12	229523	229534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	472335479
4540	NC_020834	TTGG	2	8	229544	229551	0 %	50 %	50 %	0 %	472335479
4541	NC_020834	TAT	2	6	229593	229598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335479
4542	NC_020834	TGG	2	6	229687	229692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335479
4543	NC_020834	AGC	2	6	229821	229826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335479
4544	NC_020834	TC	3	6	229911	229916	0 %	50 %	0 %	50 %	472335479
4545	NC_020834	CGG	2	6	229989	229994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335479
4546	NC_020834	G	6	6	230007	230012	0 %	0 %	100 %	0 %	472335479
4547	NC_020834	CAT	2	6	230034	230039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335479
4548	NC_020834	ATT	2	6	230047	230052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335479
4549	NC_020834	TAC	2	6	230098	230103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335479
4550	NC_020834	CAA	2	6	230104	230109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335479
4551	NC_020834	ATC	3	9	230125	230133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335479
4552	NC_020834	GAG	2	6	230171	230176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335479
4553	NC_020834	TAT	2	6	230311	230316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335480
4554	NC_020834	TGG	2	6	230538	230543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335480
4555	NC_020834	CAA	2	6	230672	230677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335480
4556	NC_020834	ACC	2	6	230723	230728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335480
4557	NC_020834	ATT	2	6	230744	230749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335480
4558	NC_020834	GGT	2	6	230770	230775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335480
4559	NC_020834	GATT	2	8	230827	230834	25 %	50 %	25 %	0 %	472335480
4560	NC_020834	CAAAGC	2	12	230845	230856	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472335480
4561	NC_020834	TGGT	2	8	230913	230920	0 %	50 %	50 %	0 %	472335480
4562	NC_020834	GAA	2	6	230963	230968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335480
4563	NC_020834	CAG	2	6	230988	230993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335480
4564	NC_020834	A	6	6	230994	230999	100 %	0 %	0 %	0 %	472335480
4565	NC_020834	AGT	2	6	231026	231031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335480
4566	NC_020834	GCT	2	6	231248	231253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335480
4567	NC_020834	TG	3	6	231257	231262	0 %	50 %	50 %	0 %	472335480
4568	NC_020834	TCA	2	6	231318	231323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335480
4569	NC_020834	CGC	2	6	231331	231336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335480
4570	NC_020834	TGA	2	6	231337	231342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335480
4571	NC_020834	GAA	2	6	231362	231367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335480
4572	NC_020834	CGG	2	6	231408	231413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335480
4573	NC_020834	GGTG	2	8	231423	231430	0 %	25 %	75 %	0 %	472335480
4574	NC_020834	GTGA	2	8	231434	231441	25 %	25 %	50 %	0 %	472335480
4575	NC_020834	TAA	2	6	231446	231451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335480
4576	NC_020834	T	7	7	231494	231500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_020834	A	6	6	231547	231552	100 %	0 %	0 %	0 %	472335481
4578	NC_020834	GTT	2	6	231608	231613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335481
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4580	NC_020834	CTAT	2	8	231651	231658	25 %	50 %	0 %	25 %	472335481
4581	NC_020834	AT	3	6	231680	231685	50 %	50 %	0 %	0 %	472335481
4582	NC_020834	GCA	2	6	231710	231715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335481
4583	NC_020834	T	7	7	231722	231728	0 %	100 %	0 %	0 %	472335481
4584	NC_020834	ATT	2	6	231745	231750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335481
4585	NC_020834	ATG	2	6	231755	231760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335481
4586	NC_020834	TTA	2	6	231764	231769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335481
4587	NC_020834	TTTTA	2	10	231775	231784	20 %	80 %	0 %	0 %	472335481
4588	NC_020834	CTT	2	6	231791	231796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335481
4589	NC_020834	AGC	2	6	231880	231885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335481
4590	NC_020834	AAT	2	6	231893	231898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335481
4591	NC_020834	AGA	3	9	231924	231932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335481
4592	NC_020834	A	6	6	231932	231937	100 %	0 %	0 %	0 %	472335481
4593	NC_020834	AATATC	2	12	231948	231959	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4594	NC_020834	T	6	6	231966	231971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_020834	TAT	2	6	231975	231980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_020834	CTT	2	6	231981	231986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_020834	ATT	2	6	231991	231996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_020834	AT	3	6	232056	232061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_020834	GTATT	2	10	232097	232106	20 %	60 %	20 %	0 %	472335482
4600	NC_020834	TATT	2	8	232132	232139	25 %	75 %	0 %	0 %	472335482
4601	NC_020834	CAAT	2	8	232144	232151	50 %	25 %	0 %	25 %	472335482
4602	NC_020834	TATT	2	8	232170	232177	25 %	75 %	0 %	0 %	472335482
4603	NC_020834	ATA	2	6	232187	232192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335482
4604	NC_020834	ACCG	2	8	232294	232301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_020834	TTC	2	6	232352	232357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335483
4606	NC_020834	T	6	6	232364	232369	0 %	100 %	0 %	0 %	472335483
4607	NC_020834	AAG	3	9	232494	232502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335483
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4609	NC_020834	TGT	2	6	232639	232644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335483
4610	NC_020834	CTT	2	6	232753	232758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335483
4611	NC_020834	ATAA	2	8	232774	232781	75 %	25 %	0 %	0 %	472335483
4612	NC_020834	CCG	2	6	232824	232829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335483
4613	NC_020834	GCC	2	6	232911	232916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335483
4614	NC_020834	GCG	2	6	232952	232957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335483
4615	NC_020834	TGC	2	6	233072	233077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335483
4616	NC_020834	TGG	2	6	233104	233109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335483
4617	NC_020834	T	7	7	233152	233158	0 %	100 %	0 %	0 %	472335483
4618	NC_020834	TCA	2	6	233163	233168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335483
4619	NC_020834	TTC	2	6	233210	233215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335483
4620	NC_020834	AAT	2	6	233309	233314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335483
4621	NC_020834	AT	3	6	233353	233358	50 %	50 %	0 %	0 %	472335484
4622	NC_020834	CGGA	2	8	233466	233473	25 %	0 %	50 %	25 %	472335484
4623	NC_020834	T	6	6	233511	233516	0 %	100 %	0 %	0 %	472335484
4624	NC_020834	TCA	2	6	233566	233571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335484
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4732	NC_020834	C	8	8	238666	238673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4733	NC_020834	TTTTAT	2	12	238693	238704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4734	NC_020834	ATTGAT	2	12	238923	238934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472335489
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4737	NC_020834	CAT	2	6	239013	239018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335489
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4740	NC_020834	CTGA	2	8	239238	239245	25 %	25 %	25 %	25 %	472335489
4741	NC_020834	TAC	2	6	239280	239285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335489
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4864	NC_020834	ATG	2	6	246191	246196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4996	NC_020834	TGAT	2	8	253336	253343	25 %	50 %	25 %	0 %	472335508
4997	NC_020834	AGC	2	6	253379	253384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335508
4998	NC_020834	GGTT	2	8	253385	253392	0 %	50 %	50 %	0 %	472335508
4999	NC_020834	TTG	2	6	253434	253439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335508
5000	NC_020834	AAGA	2	8	253492	253499	75 %	0 %	25 %	0 %	472335508

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